رچت و کلنک قهرمانان دوست داشتنی ما ماموریت دارند تا وندرا و نیفتن دوقلوهای بد ذات را تا زندان مرکزی ورتکس همراهی کنند. در بین راه نیفتن نقشه ای طراحی می کند که توسط آن دوقلوها موفق به فرار می شوند. رچت و کلنک رد آن ها را تا سیاره یرک دنبال می کند. در این سیاره آن ها با چند شهر شبح زده مواجه می شوند که اتفاقات عجیب و غریبی در آن ها در حال رخ دادن است. Ratchet & Clank Into the Nexus که آخرین قسمت از سری Ratchet & Clank Future محسوب می شود به حال و هوای بازی های قدیمی این مجموعه نزدیک شده و شامل یک بخش داستانی نسبتا کوتاه با سکوبازی های نه چندان سخت و محیطی شاد و رنگارنگ است.


مانند همه عناوین Ratchet & Clank در این بازی نیز تعداد زیادی سلاح و وسیله جور واجور در اختیار دارید که برای مبارزه با دشمنان و همچنین انجام سکوبازی ها از آن ها استفاده خواهید کرد. نحوه استفاده از آن ها بسیار شبیه بازی های گذشته است و تنها در نوع کاربرد با هم تفاوت دارند. برای مثال سلاح جدیدی به نام وینتریزر با ایجاد یک گردباد قوی باعث می شود تا دشمنان منجمد شده و به آدم برفی تبدیل شوند و یا وسیله ای به نام ریپالسر این توانایی را دارد که دشمنان را بین زمین و آسمان معلق نگه دارد. بازی شامل مراحلی است که در آن ها شخصیت کلنک را با زاویه دید از پهلو، شبیه عناوین دو بعدی کنترل می کنید. در این مراحل که حالتی معمایی دارند، باید کلنک را در یک مسیر پر پیچ و خم و خطرناک، تا مقصد راهنمایی کنید و مانع از به دام افتادن او توسط یک شبح خوفناک شوید. در مراحل عادی بازی بیشتر اوقات یا در حال مبارزه با ربات های تهی مغز هستید و یا فتح سکوهای مختلف با استفاده از توانایی های رچت و کلنکی. استفاده رچت از وسیله پرنده نیز یکی از کارهای جالب برای انجام دادن در بازی است که برای دست یابی به سکوهای دور و مرتفع بسیار کاربرد دارد. برخی مراحل بازی نیز در حالت بی وزنی اتفاق می افتند که این موضوع در متنوع تر شدن روند آن نقش به سزایی ایفا می کند.